Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTD2Q9H8S5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTD2Q9H8S5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms