Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 AC009093.6-201ENST00000622268 553 ntBASIC7.96□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 ANXA2-213ENST00000558558 513 ntTSL 37.95□□□□□ -1.143e-8■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 VOPP1-205ENST00000427700 632 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.162e-6■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 ANXA2-202ENST00000396024 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 ABR-232ENST00000575770 618 ntTSL 56.16□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 ANXA2-207ENST00000557906 812 ntTSL 55.7□□□□□ -1.53e-8■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 ANXA2-217ENST00000559113 564 ntTSL 55.37□□□□□ -1.553e-8■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 ANXA2-221ENST00000559467 755 ntTSL 55.04□□□□□ -1.63e-8■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 ANXA2-216ENST00000558998 543 ntTSL 54.9□□□□□ -1.633e-8■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 ANXA2-212ENST00000558503 828 ntTSL 54.61□□□□□ -1.673e-8■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.172e-6■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.322e-11■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 FTX-211ENST00000603672 1077 ntTSL 512.14□□□□□ -0.472e-11■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 FTX-209ENST00000602812 2356 ntTSL 1 (best)9.7□□□□□ -0.862e-11■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.92e-11■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 FTX-206ENST00000602420 751 ntTSL 35.31□□□□□ -1.562e-11■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.632e-11■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 FTX-218ENST00000641360 3897 nt4.56□□□□□ -1.682e-11■■■■□ 21.9
CSTF2TQ9H0L4 KRTAP5-AS1-202ENST00000524947 570 ntTSL 418.46■□□□□ 0.553e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.543e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.015e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.965e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 R3HDM4-206ENST00000590454 1006 ntTSL 319.76■□□□□ 0.755e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 R3HDM4-204ENST00000589428 1704 ntTSL 319.63■□□□□ 0.735e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 DCAF6-211ENST00000489398 1727 ntTSL 27.04□□□□□ -1.284e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 WDR6-212ENST00000472878 556 ntTSL 515.67■□□□□ 0.13e-9■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 WDR6-209ENST00000461687 555 ntTSL 414.32□□□□□ -0.123e-9■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.644e-8■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 SH3BP2-208ENST00000504294 557 ntTSL 513.55□□□□□ -0.242e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.852e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 ITM2C-206ENST00000457215 763 ntTSL 415.22■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 ITM2C-208ENST00000541852 572 ntTSL 314.19□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.242e-10■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.051e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 EP400NL-203ENST00000392352 2172 ntTSL 222.33■■□□□ 1.171e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 EP400NL-205ENST00000443539 1756 ntTSL 220.3■□□□□ 0.841e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 EP400NL-204ENST00000407361 945 ntTSL 320.14■□□□□ 0.811e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 EP400NL-202ENST00000389560 1726 ntTSL 1 (best)19.79■□□□□ 0.761e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 EP400NL-211ENST00000539205 583 ntTSL 318.43■□□□□ 0.541e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 EP400NL-207ENST00000454179 781 ntTSL 218.13■□□□□ 0.491e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 EP400NL-209ENST00000488030 1366 ntTSL 216.51■□□□□ 0.231e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PRR36-201ENST00000615988 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.68■■□□□ 1.221e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 MBD3-208ENST00000590830 1035 ntTSL 1 (best)20.87■□□□□ 0.931e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.441e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.27■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 FAAP20-211ENST00000469733 2280 ntTSL 215.48■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 ERICH1-202ENST00000518277 788 ntTSL 215.38■□□□□ 0.051e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 ERICH1-211ENST00000524138 682 ntTSL 315.11■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 FAAP20-213ENST00000487186 3576 ntTSL 213.39□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 RFX3-210ENST00000457373 822 ntTSL 59.4□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 RFX3-201ENST00000302303 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.031e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 TBCK-220ENST00000515705 592 ntTSL 58.51□□□□□ -1.051e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 RFX3-207ENST00000449190 869 ntTSL 38.48□□□□□ -1.051e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 RFX3-209ENST00000451859 740 ntTSL 38.19□□□□□ -1.11e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 TBCK-219ENST00000514689 703 ntTSL 37.31□□□□□ -1.241e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.481e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.491e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.424e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.374e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.364e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.524e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.554e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.574e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.574e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PLEKHG5-204ENST00000377732 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.664e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 NLGN2-203ENST00000572893 305 ntTSL 322.79■■□□□ 1.243e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.363e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PTPN12-205ENST00000433369 552 ntTSL 511.84□□□□□ -0.511e-10■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PTPN12-203ENST00000415482 2316 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.991e-10■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.177e-8■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 BCAT2-212ENST00000601681 1016 ntTSL 1 (best)13.95□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 BCAT2-211ENST00000601496 589 ntTSL 411.46□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.43e-7■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 JADE3-202ENST00000455411 492 ntTSL 418.33■□□□□ 0.524e-9■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.24e-9■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.364e-9■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 JADE3-201ENST00000424392 636 ntTSL 35.93□□□□□ -1.464e-9■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PAK4-204ENST00000593480 714 ntTSL 318.69■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 417.65■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PAK4-207ENST00000597766 380 ntTSL 317.15■□□□□ 0.341e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 21.8
CSTF2TQ9H0L4 CYTH1-216ENST00000591574 1043 ntTSL 323■■□□□ 1.273e-7■■■■□ 21.7
CSTF2TQ9H0L4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.393e-7■■■■□ 21.7
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