Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC90BQ9GZT6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms