Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLR1EQ9GZS1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR1EQ9GZS1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms