Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM5Q9C035 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms