Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NMES1Q9C002 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMES1Q9C002 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms