Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms