Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GSDMCQ9BYG8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GSDMCQ9BYG8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms