Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VN1R3Q9BXE9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms