Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BPIFA3Q9BQP9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BPIFA3Q9BQP9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms