Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LPIN3Q9BQK8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms