Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VGLL1Q99990 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms