Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms