Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALS2CR12Q96Q35 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms