Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SAMD8Q96LT4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SAMD8Q96LT4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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SAMD8Q96LT4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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SAMD8Q96LT4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SAMD8Q96LT4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SAMD8Q96LT4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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SAMD8Q96LT4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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SAMD8Q96LT4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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