Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SENP8Q96LD8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms