Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKNOX2Q96KN3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKNOX2Q96KN3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms