Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCARF2Q96GP6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCARF2Q96GP6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms