Protein–RNA interactions for Protein: Q96G97

BSCL2, Seipin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSCL2Q96G97 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BSCL2Q96G97 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms