Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TVP23CQ96ET8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TVP23CQ96ET8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms