Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SHISA4Q96DD7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA4Q96DD7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA4Q96DD7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA4Q96DD7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA4Q96DD7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA4Q96DD7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA4Q96DD7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA4Q96DD7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA4Q96DD7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA4Q96DD7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA4Q96DD7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA4Q96DD7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHISA4Q96DD7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHISA4Q96DD7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms