Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TUBGCP3Q96CW5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms