Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTSSAQ969W0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTSSAQ969W0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms