Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD50Q92878 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD50Q92878 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms