Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF4BQ92750 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms