Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RUFY2Q8WXA3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RUFY2Q8WXA3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms