Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
WHAMMQ8TF30 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms