Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SVBPQ8N300 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms