Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJD3Q8N144 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJD3Q8N144 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms