Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC170Q8IYT3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC170Q8IYT3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms