Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLFN12Q8IYM2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms