Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC8AQ8IWT6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms