Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM139Q8IV31 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM139Q8IV31 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms