Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX29P2Q8IUI4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms