Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HAPLN4Q86UW8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms