Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG9AQ7Z3C6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms