Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APTXQ7Z2E3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APTXQ7Z2E3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms