Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAL3Q7RTP6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms