Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SV2BQ7L1I2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms