Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HECW1Q76N89 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
HECW1Q76N89 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HECW1Q76N89 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms