Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms