Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LCLAT1Q6UWP7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCLAT1Q6UWP7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms