Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SFTA2Q6UW10 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SFTA2Q6UW10 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SFTA2Q6UW10 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SFTA2Q6UW10 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SFTA2Q6UW10 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SFTA2Q6UW10 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SFTA2Q6UW10 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SFTA2Q6UW10 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SFTA2Q6UW10 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SFTA2Q6UW10 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SFTA2Q6UW10 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTA2Q6UW10 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTA2Q6UW10 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SFTA2Q6UW10 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms