Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM88Q6PEY1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms