Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC27A1Q6PCB7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A1Q6PCB7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC27A1Q6PCB7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms