Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRPF40BQ6NWY9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF40BQ6NWY9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms