Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NANOGP8Q6NSW7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms