Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
OBSCNQ5VST9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms