Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDGFL1Q5TGJ6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms