Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COLEC12Q5KU26 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COLEC12Q5KU26 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms